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Lawrence
Livermore National Laboratories/University
of California
at San Francisco (LLNL/UCSF).
Esta base de datos
sólo incluye casos cuyo hallazgo mamográfico sean microcalcificaciones.
Presenta 198 imágenes de 50 pacientes en 12 CD-ROM, con dos proyecciones de
cada mama (OML y CC), excepto en un caso de una mujer mastectomizada.
Contenido de cada caso:
· Archivo ".ics".
Las imágenes se encuentran almacenadas
en formato ICS, un sistema de diseñado inicialmente para imágenes de
citometría.
Cada imagen posee dos archivos: uno es un archivo de cabecera en texto ascii con
extensión ".ics", el cual contiene información descriptiva como el
tamaño de la imagen y otra información asociada al caso. El otro, con extensión
".ids", contiene los datos de la imagen (en realidad éste último es
un fichero raw, que se puede abrir con cualquier programa que lea archivos raw).
Por tanto existen 197 mamografías con dos archivos cada una (el archivo de
cabecera "ics" y el archivo con los datos de la imagen "ids").
Los archivos se nombran con dos letras
que son el código de la paciente, seguido de "r" o "l" según
se trate de la mama derecha o izquierda, seguido de dos letras más que indican
la proyección ("ml" mediolateral y "cc"
· Archivos de las áreas sospechosas.
Existen 192 imágenes con áreas
sospechosas identificadas. Estas áreas son determinadas por radiólogos
expertos, mediante el siguiente proceso. Las mamografías se digitalizan y
presentan en la pantalla del ordenador. Entonces utilizando la mamografía
original y toda la información que existe disponible del caso historia clínica,
diagnóstico, resultado de la biopsia..., los radiólogos marcan las
calcificaciones (incluyendo las que presentan resultado benignos tras varios años
de seguimiento), señalando el perímetro de la calcificación y rellenando el
área de esta. Si existe una agrupación de calcificaciones, tanto si son
benignas como malignas, los radiólogos señalan la extensión de la región que
ocupan. Estos resultados se dibujan en el ordenador en la imagen digital
archivada y se guardan en dos archivos: el primer archivo es el de las
calcificaciones individuales, tanto si estas forman parte o no de una agrupación,
en el otro archivo el área demarcada como región de la agrupación se almacena
como área sólida, no como contorno. Las 192 imágenes están organizadas de la
siguiente manera:
· 142 x 2 archivos que contienen la definición de microcalcificaciones
individuales en forma binaria, con su perímetro señalado y el interior
relleno. En cada agrupación de microcalcificaciones se marcan unas cuantas de
ellas. También han sido marcadas algunas calcificaciones benignas que no forman
parte de ningún grupo. El nombre de estos archivos lleva añadido
"-mc".
· 50 x 2 archivos contienen una máscara binaria (área) que cubre la extensión
la que se encuentra una agrupación de microcalcificaciones. En estas imágenes
en el nombre del archivo aparecerá -cr, al final.
· Case-info: Es un archivo de extensión
ascii, que contiene datos de la paciente,
como tipo de mama, grado de sutileza de la lesión, los resultados de la biopsia
y comentarios constatados. Este archivo se encuentra en cada CD, incluyendo la
información de todos los casos que contiene.
· Manifest: Es un archivo ascii, en el que aparecen una lista de todos los casos
contenidos en cada CD.
· Readme.ics: este archivo ascii contiene información sobre el formato
ICS.
· ICS2ppma: se trata de un archivo con un programa para transformar imágenes en
formato '.ics' a otro más usual '.ppm'.
· Readme: en este archivo, presente en cada CD, se explica con más detalle todo
lo comentado anteriormente.
Características de las imágenes:
Las imágenes son digitalizadas con un
escáner láser, con una resolución de 35 micras y 12 bits de profundidad de
niveles de gris.
Adquisición e información sobre la
base de datos: La base de datos completa está constituida por doce CD-ROM. Para
su adquisición contactar con:
Laura N Mascio
Biomedical Image Processing
Lawrence Livermore National Laboratory
PO Box 808, L-452
Livermore, CA 94551
Teléfono: (510) 422-0924
Fax: (510) 422-2282
Correo electrónico: lmascio@llnl.gov
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